学院设有马克思主义学院、基础医学院、临床医学系、护理学系、中医药系、药学系、预防医学系、皇普谧针灸学院、公共课教学部、继续教育学院等10个二级教学机构，设有图书馆、信息中心两个教学辅助机构，开设有临床医学、护理学、药学、医学检验技术、中药学、康复治疗学、儿科学、助产学、预防医学、针灸推拿学等10个本科专业和11个专科专业，初步形成“医、护、药、技”齐全的学科专业体系。
学院现有临床医学和护理学等4个省级特色专业、3个省级一流本科专业建设点，建成国家级一流本科课程（线下）1门、省级一流本科课程9门、省级精品课程5门、省级精品资源共享课程5门、省级教学团队4个。近年来获省级教学成果奖3项，省级教改立项42项。近三年大学生创新创业训练计划项目国家级立项 25项、省级立项48项。承担厅局级以上各类科研项目64项，发表学术论文658篇，其中核心期刊论文101篇，参编教材73部，参编专著32部，授权专利128项，各类科研奖励22项。
学院有8个实验教学中心、1所直属附属医院、3所非直属附属医院、42个实践教学基地，其中省级实验教学示范中心4个，建有全国基层西学中能力建设带教基地、国家中医类别执业医师资格考试实践技能考试基地。附属医院是综合性三级甲等医院，建有全国住院医师规范化培训基地、全国肝炎患者教育基地、甘肃省手术室专科护士培训基地，甘肃省骨科研究所平凉分所、甘肃省肝胆胰外科研究所平凉分所、兰州大学临床医学院肿瘤防治中心平凉分中心。
学校是教育部确定的天津医科大学对口支援学校，“黄河流域医学院校联盟”成员单位，与兰州大学第一医院、甘肃省人民医院、甘肃奇正藏药有限公司、甘肃数字本草检验中心有限公司等省内外医院、药品生产企业合作共建，与俄罗斯莫斯科国立第一医科大学等国外高校开展学术交流，与台湾辅英科技大学进行学生联合培养。
建校60多年来，学校始终秉承“养德崇医、见贤思齐”的校训，致力于培养医德高尚、基础厚实、技术过硬、扎根基层的高素质应用型医药卫生人才，大部分毕业生扎根基层医疗卫生一线，学校先后荣获“全国卫生文明先进单位” “省级文明校园”“甘肃省民族团结进步模范集体”“甘肃省就业工作先进集体”等荣誉称号，涌现出中国大学生自强之星、全国“孝老爱亲”道德模范、“最美白衣天使”、“感动宁夏人物”、第七届甘肃省“孝老爱亲”道德模范等一批优秀校友。十四五”期间，学院将以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，全面贯彻党的教育方针，坚持党建统领，遵循高等教育规律和医学人才成长规律，围绕“服务生命全周期、健康全过程”健全专业体系，紧扣“以健康为中心”转变教育理念，以“服务健康甘肃”战略为导向，推进医教协同、产教融合，培养扎根基层的高素质应用型医药卫生人才，为建设中国式现代化甘肃篇章做出积极贡献。
